Für die BAG W sind Gesundheit und medizinische Versorgung Wohnungsloser ein zentrales Thema. Bereits 1998 wurde die AG Medizinische Versorgung wohnungsloser Menschen (AG Med) gegründet, der Fachausschuss Gesundheit der BAG W existiert seit 2002. In zweijährigem Rhythmus finden die Fachtagungen der AG Med statt.